Przedsięwzięcia dostosowujące przedsiębiorstwa do wymogów ochrony środowiska; V. Ochrona przyrody i kształtowanie postaw ekologicznych. Dla powyższych priorytetów Instytucją Pośredniczącą jest Ministerstwo Środowiska. Głównym celem priorytetu I (3275 mln EUR), zatytułowanego: Gospodarka wodno-ściekowa, jest redukcja ilości zanieczyszczeń odprowadzanych ze ściekami do wód i ziemi. Priorytet II (1430 mln EUR) Gospodarka odpadami i ochrona powierzchni ziemi, obejmuje działania w zakresie zapobiegania oraz ograniczania wytwarzania odpadów komunalnych, wdrażania technologii odzysku, w tym recyklingu, wdrażania technologii unieszkodliwiania odpadów komunalnych, a także likwidacji zagrożeń wynikających ze składowania odpadów zgodnie z krajowym i wojewódzkimi planami gospodarki odpadami. Priorytet III (655 mln EUR), Zarządzanie zasobami i przeciwdziałanie zagrożeniom środowiska, odnosi się do inwestycji, które przyczyniają się do ograniczenia ryzyka zagrożeń ekologicznych. Przykładowe projekty dotyczą odtwarzania i modernizowania zabudowy hydrotechnicznej, renaturyzacji, przywracające funkcjonalność przyrodniczą, hamujące odpływ wody, zwiększające naturalną retencję i bezpieczeństwo przeciwpowodziowe. Ponadto wsparcie uzyskają działania prowadzące do wzrostu dyspozycyjnych zasobów wody, oraz w zakresie zapobiegania i przeciwdziałania awariom i monitorowania stanu środowiska